簡(jiǎn)要描述:采用LabChip GX Touch核酸分析儀,可在幾十秒內(nèi)完成DNA、RNA定量和片段大小分析。LabChip電泳分析采用現(xiàn)代的微流控芯片技術(shù)。僅需不到150nL的樣本,即可進(jìn)行片段大小和濃度分析,生成高分辨率、可重復(fù)的數(shù)據(jù)。LabChip GX Touch核酸分析儀支持各種應(yīng)用,包括驗(yàn)證PCR擴(kuò)增產(chǎn)物、總DNA及各片段定量、優(yōu)化NGS工作流程等。
詳細(xì)介紹
品牌 | revvity | 產(chǎn)地類別 | 進(jìn)口 |
---|---|---|---|
應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,食品,化工,制藥,綜合 |
LabChip GX Touch系統(tǒng)具有以下功能:
2 LabChip微流控技術(shù),可進(jìn)行現(xiàn)代化凝膠電泳分析
2 全自動(dòng)基因組樣本實(shí)時(shí)分析,樣本檢測(cè)分析可快至30秒
2 數(shù)字化數(shù)據(jù)格式,便于分析、查看、分享和存檔
2 RNA、DNA樣本完整性量化指標(biāo),確保只有最佳樣本才可進(jìn)入下游流程
2 最高批處理通量 24 個(gè)樣品的高效平臺(tái)節(jié)約時(shí)間和試劑用量;
最高批處理通量 384 個(gè)樣品的型號(hào)則適用于高通量工作流程
無論您的測(cè)序?qū)嶒?yàn)室需要分析稀缺和珍貴樣品,還是運(yùn)行 PCR-free的流程,亦或是需要對(duì)樣品中的每個(gè)片段定量以進(jìn)行基因分型分析,方便易用、成本低、通量高且靈活的 LabChip GX Touch 核酸分析儀可以極大地減輕分析日益增多的樣品的負(fù)擔(dān)。
LabChip GX Touch 觸摸屏簡(jiǎn)化了樣品的分析:
1. Touch — 人性化操作
2 加載樣品板和芯片
2 選擇樣品(一次最多運(yùn)行 384 個(gè)樣品)
2 選擇實(shí)驗(yàn)類型
2 觸點(diǎn)“ 運(yùn)行 ",開始實(shí)驗(yàn)
2 您甚至可以讓系統(tǒng)自動(dòng)將數(shù)據(jù)直接導(dǎo)出到您的網(wǎng)
2 絡(luò)或 LIMS 系統(tǒng)(圖 2)
圖2. 數(shù)據(jù)分析從一個(gè)易于使用的觸摸屏界面開始
2. 運(yùn)行 — 實(shí)時(shí)觀察運(yùn)行
2 樣品分析耗時(shí)少至 30 秒
2 數(shù)據(jù)采集過程中電泳峰圖實(shí)時(shí)可見
2 在運(yùn)行環(huán)境中將采集到的數(shù)據(jù)疊加比較樣品譜式
2 挑選不同運(yùn)行時(shí)間分析特征注釋
3. 回顧 — 實(shí)時(shí)查看數(shù)據(jù)或?qū)С鲆源蘸蠓治?/span>
2 選擇以電泳峰圖、虛擬膠圖或數(shù)據(jù)表格形式顯示(圖 3)
2 使用 TIBCO Spotfire® 數(shù)據(jù)可視化軟件強(qiáng)化分析結(jié)果
2 收集選擇多板樣品的數(shù)據(jù)進(jìn)行平行分析比對(duì)
2 挑選過濾具備關(guān)鍵屬性應(yīng)用的數(shù)據(jù)
2 突出顯示目標(biāo)峰譜
圖3. 靈活的數(shù)據(jù)選項(xiàng)允許多種格式的實(shí)時(shí)查看或?qū)С?/span>
LabChip GX Touch 軟件能夠通過少量設(shè)置來進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)設(shè)置參數(shù)文件可下載到儀器上,并通過觸摸按鍵執(zhí)行。自動(dòng)保留最近一次實(shí)驗(yàn)運(yùn)行的參的實(shí)驗(yàn)參數(shù)繼續(xù)運(yùn)行多批樣品。
數(shù),以方便以相同數(shù)據(jù)查看軟件模塊可幫助科學(xué)家從遠(yuǎn)離實(shí)驗(yàn)室的工作查看已完成的樣品。軟件的使用許可證無數(shù)量限區(qū)制,同事之間可共享數(shù)據(jù),使得項(xiàng)目合作變得簡(jiǎn)單而直接。
LabChip GX Touch數(shù)據(jù)文件可與 TIBCO Spotfire 兼容(可選功能)。
只將高質(zhì)量的核酸樣品送到下游
電泳分析是二代測(cè)序文庫質(zhì)控的重要環(huán)節(jié),它可同時(shí)提供每個(gè)樣品的片段大小以及定量信息。LabChip GX Touch 自動(dòng)完成DNA和RNA片段以及smear樣品的片段大小和濃度分析,用于測(cè)序的文庫樣品的質(zhì)控。片段樣品分析通常用于交叉檢驗(yàn)片段化或者PCR步驟的效果。文庫樣品的DNA總量分析均均一化步驟。
節(jié)約樣品
減少分析時(shí)樣品的消耗,是很多實(shí)驗(yàn)室考慮的重要因素。對(duì)于諸如染色體免疫共沉淀測(cè)序和 PCR-free 等方法制備的濃度非常低的文庫樣品,這一點(diǎn)至關(guān)重要。NGS 3K 試劑盒就是專為這類有特別高靈敏度要求的測(cè)序流程而開發(fā)的。LabChip 可以對(duì)濃度低至 2.5pg/μL
的 smear 以及 0.2pg/μL 的片段進(jìn)行準(zhǔn)確定量,實(shí)現(xiàn)對(duì)稀缺和珍貴樣品的快速分析(圖 4)。
圖4.上圖顯示了DNA NGS 3K檢測(cè)樣品的靈敏度。同一NGS文庫樣品進(jìn)行6次3倍系列稀釋,實(shí)驗(yàn)結(jié)果展示了LabChipDNA NGS 3K檢測(cè)樣品濃度下限。數(shù)據(jù)結(jié)果在LabChip GXTouch儀器上展示。
快速分析 RNA
LabChip Touch 平臺(tái)提供了易于理解的 RNA 濃度以及核糖體 RNA 的比例,與 RNA 質(zhì)量評(píng)分共同用作完整性評(píng)價(jià)指標(biāo)(圖 5)。RNA 質(zhì)量評(píng)分 (RQS) 是對(duì)樣品的質(zhì)量和完整性的量化評(píng)價(jià),可預(yù)測(cè)下游基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)(如芯片分析或?qū)崟r(shí) PCR 等)的成功幾率。
除 RQS 值外,分析軟件現(xiàn)在可以自動(dòng)計(jì)算 DV200 值。這兩個(gè)值可以導(dǎo)出,并用于確定來自諸如 FFPE 標(biāo)本的RNA 樣品的質(zhì)量。經(jīng)驗(yàn)證,RQS 與 Agilent® RIN(RNA
完整性指數(shù))密切相關(guān)并遵循相同的 0-10 量化評(píng)級(jí)。
基因組 DNA 樣品降解評(píng)分
為 LabChip GX Touch 系統(tǒng)開發(fā)的基因組 DNA 實(shí)驗(yàn)創(chuàng)新性的引入了基因組 DNA 質(zhì)量評(píng)分(GQS),替代傳統(tǒng)的凝膠電泳。所提供的電子數(shù)據(jù),兼容實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)、可以輕松歸檔和分發(fā)。可在 30 - 60 秒內(nèi)快速分析 25 - 12000bp 的 DNA 樣品(對(duì)于 gDNA 完整性檢測(cè)上限可達(dá) 40000 bp)(圖 6)。
圖5. RNA 電泳圖譜,其中展示 18S 和 28S 峰
圖6. 以電泳圖譜展示的基因組 DNA 質(zhì)量評(píng)估
Small RNA 分析
LabChip小RNA試劑盒能夠快速分離和測(cè)定多種片段范圍在20至150核甘酸(nt)之間的小RNA樣品,包括miRNA、siRNA、piRNA、tRNA以及CRISPR-gRNA。這個(gè)全新的小RNA分析方法可快速自動(dòng)分析小RNA片段大小和相對(duì)豐度從而可以達(dá)到節(jié)省時(shí)間和成本。
LabChip微流控毛細(xì)管電泳技術(shù)能夠在一分鐘內(nèi)自動(dòng)分離和分析小RNA樣品。系統(tǒng)軟件自動(dòng)分析數(shù)據(jù),通過采用內(nèi)部參考品和標(biāo)準(zhǔn)品來確定小RNA樣品的片段大小和濃度(圖7)。
圖7.LabChip小RNA檢測(cè)方法可自動(dòng)測(cè)定小RNA樣本的片段片段大小, 具有很高的準(zhǔn)確度和精密度。
Labchip 電泳
工作原理
LabChip 電泳在小型微流控芯片上進(jìn)行(圖 8)。將芯片裝載入 LabChip GX Touch 系統(tǒng)后,芯片孔與鉑電極接觸,由鉑電極提供電壓和電流控制。系統(tǒng)機(jī)械臂將微孔板上的樣品孔直接移動(dòng)到芯片的毛細(xì)管“ 吸管 "下方,約 150 nL 樣品被抽吸到芯片上。待分析樣品逐一被電泳分離,樣品條帶被激光誘導(dǎo)熒光檢測(cè)。通過 ladder 及內(nèi)標(biāo)確定各條帶的大小和濃度。
圖 8. Labchip 電泳工作原理
LabChip GX Touch 試劑規(guī)格
試劑盒 | 片段大小與線性濃度范圍 |
DNA 1K | 25 bp ? 1000 bp, 0.1 ng/μL ? 50 ng/μL ( 片段) |
DNA 5K | 50 bp- 5000 bp, 0.25 ng/μL ? 50 ng/μL ( 片段 ) |
DNA 12K | 100 bp- 12,000 bp, 0.25 ng/μL ? 50 ng/μL ( 片段 ) |
DNA HiSens | 50 bp- 5000 bp, 10 pg/μL ? 500 pg/μL ( 片段 ), 100 pg/μL ? 5 ng/uL (Smear) |
NGS 3K | 50 bp- 3000 bp,0.5 pg/μL ? 50 pg/μL ( 片段), 2.5 pg/μL ? 500 pg/uL (Smear) |
gDNA | 50 bp - 40,000 bp, 0.2 ng/μL ? 5 ng/μL ( 總濃度 ) |
cf DNA | 50-800bp,5-100pg/μL(單核小體檢測(cè)濃度) |
RNA | 100 ? 6,000 nt, 25 ng/μL ? 250 ng/μL ( 總濃度 ) |
Pico RNALabChip | 100 ? 6,000 nt, 500 pg/μL ? 5 ng/μL ( 總濃度 ) |
Small RNA | 20-150nt,100 ?10,000 pg/µL(總濃度) |
訂購信息
試劑名稱 | LabChip GX Touch HT | LabChip GX Touch 24 |
LabChip DNA Extended Range | 760517 | CLS138948 |
DNA 1K試劑盒 | CLS760673 | CLS760673 |
DNA 12K試劑盒 | 760569 | 760569 |
DNA高靈敏度試劑盒 | CSL760672 | CLS760672 |
基因組DNA試劑盒 | CLS760685 | CLS760685 |
DNA5K/RNA/Small RNA/CZE LabChip | 760435 | CLS138949 |
DNA5K/RNA LabChip(4芯片經(jīng)濟(jì)裝) | 760527 | 不適用 |
DNA5K試劑盒 | CLS760675 | CLS760675 |
標(biāo)準(zhǔn)級(jí)RNA試劑盒 | CLS960010 | CLS960010 |
皮克級(jí)RNA試劑盒 | CLS960012 | CLS960012 |
X-Mark LabChip | CLS144006 | CLS145331 |
NGS 3K試劑盒 | CLS960013 | CLS960013 |
Small RNA試劑盒 | CLS153530 | CLS153530 |
cf DNA芯片 | CLS144006 | CLS145331 |
cf DNA試劑盒 | CLS157242 | CLS157242 |
產(chǎn)品 | 貨號(hào) |
Labchip GX Touch 24 | CLS138162 |
Labchip GX Touch HT | CLS137031 |
產(chǎn)品咨詢